МУ – София приема и провежда обучение в образователно-научна степен “доктор” по акредитирани специалности в областта на медицината, стоматологията, фармацията и общественото здраве.

Формите за подготовка са:

• Редовна докторантура – с минимален срок за провеждане на докторантурата до три години след придобита степен “магистър”;
• Задочна докторантура – с минимален срок за подготовка до четири години след придобита степен “магистър”;
• Докторантура чрез самостоятелна подготовка – осигурява се обучение в съответствие с другите две форми на подготовка – с минимален срок на подготовка до 3 години след придобита степен „магистър“;

В МУ – София могат да кандидатстват за придобиване на научно-образователна степен “доктор” български и чужди граждани, притежаващи образователна степен  “магистър” по правила и ред определени от действащите в страната нормативни актове.

Приемът и подготовката на докторанти в МУ – София се извършва съобразно:

• Държавните изисквания, посочени в действащата Наредба за държавните изисквания за приемане и обучение на докторанти;
• Правилник на МУ – София за кандидатстване и провеждане на докторантурите и свободното разработване на дисертационен труд, утвърден от АС.

Подготовката на докторантите в МУ – София се организира и координира от отдел “Научно-организационен” на Ректората и съответните сектори на Деканатите на факултетите. Оригиналната документация в хода на докторантурата се съхранява в Ректората, а копия от нея в Деканатите.

Чужденци могат да се приемат като редовни, задочни и свободни докторанти в МУ – София в следните случаи:

• В изпълнение на междуправителствени спогодби за образователен, научен и културен обмен;
• Съгласно акт на МС;
• Срещу заплащане;
• Без заплащане, когато са деца на членове на персонала на дипломатически и консулски представителства, акредитирани в Република България.

Чуждестранни граждани могат да бъдат зачислени в докторантура след успешно завършване на подготвителния курс по български език в Департамента по езиково обучение.

Редовните докторанти след получаване на заповед за зачисляване имат право да бъдат зачислени на базата на успешния конкурсен изпит за докторантура и за провеждане на платена специализация. Таксата за последната се заплаща от втората учебна година и размерът й се определя от Ректора на МУ – София.